Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms