Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms