Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SbsnQ8CIT9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SbsnQ8CIT9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms