Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo43Q8CDI2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo43Q8CDI2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms