Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd4aQ8CBY1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms