Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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