Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms