Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot2Q8C5L3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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