Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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