Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYY4

Ttc39b, Tetratricopeptide repeat protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39bQ8BYY4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39bQ8BYY4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc39bQ8BYY4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms