Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp38Q8BW70 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp38Q8BW70 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp38Q8BW70 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp38Q8BW70 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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