Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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