Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp43Q8BUM9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms