Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep55Q8BT07 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep55Q8BT07 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms