Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3Q8BRE0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rd3Q8BRE0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rd3Q8BRE0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rd3Q8BRE0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms