Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nop53Q8BK35 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nop53Q8BK35 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nop53Q8BK35 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nop53Q8BK35 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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