Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Smarcal1Q8BJL0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcal1Q8BJL0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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