Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ubash3bQ8BGG7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ubash3bQ8BGG7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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