Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg4bQ8BGE6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms