Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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