Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Amigo1Q80ZD8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Amigo1Q80ZD8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Amigo1Q80ZD8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Amigo1Q80ZD8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Amigo1Q80ZD8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amigo1Q80ZD8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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