Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Negr1Q80Z24 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms