Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

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Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms