Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Alkbh8Q80Y20 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Alkbh8Q80Y20 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Alkbh8Q80Y20 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms