Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms