Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Srrm3Q80WV7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Srrm3Q80WV7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Srrm3Q80WV7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Srrm3Q80WV7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Srrm3Q80WV7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Srrm3Q80WV7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srrm3Q80WV7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms