Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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