Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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