Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms