Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms