Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shq1Q7TMX5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms