Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Scn4bQ7M729 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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