Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms