Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms