Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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