Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms