Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhod1Q6P9Q4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fhod1Q6P9Q4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms