Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms