Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nwd2Q6P5U7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms