Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms