Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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