Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tpm4Q6IRU2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tpm4Q6IRU2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tpm4Q6IRU2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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