Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lemd2Q6DVA0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms