Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp9bQ66X22 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp9bQ66X22 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms