Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms