Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms