Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms