Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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