Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Polr2kQ63871 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms