Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp4Q62445 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms